Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A1Q14973 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC10A1Q14973 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC10A1Q14973 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC10A1Q14973 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC10A1Q14973 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC10A1Q14973 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC10A1Q14973 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC10A1Q14973 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC10A1Q14973 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC10A1Q14973 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC10A1Q14973 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC10A1Q14973 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms