Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CGNL1Q0VF96 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CGNL1Q0VF96 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CGNL1Q0VF96 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms