Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNRPD2P62316 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPD2P62316 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms