Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00205P59089 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms