Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP107P57740 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP107P57740 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP107P57740 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP107P57740 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP107P57740 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP107P57740 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP107P57740 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP107P57740 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP107P57740 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP107P57740 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP107P57740 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP107P57740 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP107P57740 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP107P57740 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP107P57740 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP107P57740 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP107P57740 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP107P57740 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP107P57740 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP107P57740 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP107P57740 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP107P57740 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP107P57740 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP107P57740 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP107P57740 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP107P57740 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP107P57740 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP107P57740 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms