Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN1CP49918 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN1CP49918 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN1CP49918 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms