Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP13P45452 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP13P45452 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MMP13P45452 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP13P45452 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP13P45452 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP13P45452 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP13P45452 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP13P45452 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP13P45452 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP13P45452 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP13P45452 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP13P45452 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP13P45452 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP13P45452 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP13P45452 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP13P45452 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP13P45452 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP13P45452 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP13P45452 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms