Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARSP41250 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARSP41250 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARSP41250 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARSP41250 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARSP41250 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARSP41250 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARSP41250 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARSP41250 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARSP41250 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GARSP41250 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GARSP41250 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GARSP41250 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GARSP41250 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GARSP41250 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GARSP41250 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARSP41250 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARSP41250 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARSP41250 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARSP41250 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GARSP41250 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARSP41250 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARSP41250 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARSP41250 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARSP41250 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARSP41250 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GARSP41250 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GARSP41250 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GARSP41250 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GARSP41250 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GARSP41250 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GARSP41250 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARSP41250 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARSP41250 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARSP41250 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARSP41250 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARSP41250 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARSP41250 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARSP41250 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARSP41250 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARSP41250 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARSP41250 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms