Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNFP41002 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNFP41002 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNFP41002 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNFP41002 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNFP41002 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNFP41002 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNFP41002 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNFP41002 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNFP41002 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNFP41002 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNFP41002 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNFP41002 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNFP41002 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNFP41002 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNFP41002 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNFP41002 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNFP41002 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNFP41002 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNFP41002 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNFP41002 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNFP41002 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNFP41002 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNFP41002 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNFP41002 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNFP41002 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNFP41002 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNFP41002 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNFP41002 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNFP41002 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNFP41002 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNFP41002 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNFP41002 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNFP41002 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNFP41002 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNFP41002 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNFP41002 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNFP41002 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNFP41002 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNFP41002 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNFP41002 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNFP41002 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNFP41002 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNFP41002 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNFP41002 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNFP41002 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNFP41002 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNFP41002 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNFP41002 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNFP41002 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNFP41002 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNFP41002 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNFP41002 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNFP41002 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNFP41002 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNFP41002 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNFP41002 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNFP41002 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNFP41002 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNFP41002 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms