Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 SUR2YDR297W 1050 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 ZRT1YGL255W 1131 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YGL262WYGL262W 528 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YGR016WYGR016W 573 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 MRS3YJL133W 945 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 BUD28YLR062C 378 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 SPO77YLR341W 1434 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 snR10snR10 245 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 SER1YOR184W 1188 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YPL114WYPL114W 420 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 TOM5YPR133W-A 153 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YCL041CYCL041C 495 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 JEM1YJL073W 1938 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 MSE1YOL033W 1611 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 GAS5YOL030W 1455 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 HST1YOL068C 1512 nt4.92□□□□□ -1.62
SEC28P40509 GCN20YFR009W 2259 nt4.92□□□□□ -1.62
SEC28P40509 DNF2YDR093W 4839 nt4.92□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YER085CYER085C 522 nt4.92□□□□□ -1.62
SEC28P40509 NVJ1YHR195W 966 nt4.92□□□□□ -1.62
SEC28P40509 TRM10YOL093W 882 nt4.92□□□□□ -1.62
SEC28P40509 NAT3YPR131C 588 nt4.92□□□□□ -1.62
SEC28P40509 RAD16YBR114W 2373 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 MRPL7YDR237W 879 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 RPN12YFR052W 825 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 ARC1YGL105W 1131 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 PUS6YGR169C 1215 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 GAT4YIR013C 366 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 SPC34YKR037C 888 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 ATP14YLR295C 375 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 PRE7YBL041W 726 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 OPY2YPR075C 1083 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YCL012CYCL012C 405 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 MEF2YJL102W 2460 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 AIM10YER087W 1731 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 BDP1YNL039W 1785 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 HIS4YCL030C 2400 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 LAP3YNL239W 1365 nt4.91□□□□□ -1.62
SEC28P40509 APM1YPL259C 1428 nt4.9□□□□□ -1.62
SEC28P40509 UGA2YBR006W 1494 nt4.9□□□□□ -1.62
SEC28P40509 VPS36YLR417W 1701 nt4.9□□□□□ -1.62
SEC28P40509 COQ4YDR204W 1008 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 MNN10YDR245W 1182 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 YDR417CYDR417C 372 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 AST1YBL069W 1290 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 TLG2YOL018C 1194 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 MRM1YOR201C 1239 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 ISA2YPR067W 558 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 SKM1YOL113W 1968 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 HUL4YJR036C 2679 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 ECM32YER176W 3366 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 PCA1YBR295W 3651 nt4.9□□□□□ -1.63
SEC28P40509 FKH1YIL131C 1455 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 FRS1YLR060W 1788 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 PHO90YJL198W 2646 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 DHH1YDL160C 1521 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 KIN28YDL108W 921 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 COS4YFL062W 1140 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 BGL2YGR282C 942 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 YJL215CYJL215C 360 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 ERG3YLR056W 1098 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 COS3YML132W 1140 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 COS2YBR302C 1140 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 TSL1YML100W 3297 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 NUP116YMR047C 3342 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 DEG1YFL001W 1329 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 STB2YMR053C 2553 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 GRS1YBR121C 2004 nt4.89□□□□□ -1.63
SEC28P40509 MOT2YER068W 1764 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC28P40509 KTR7YIL085C 1554 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC28P40509 SCM3YDL139C 672 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC28P40509 FMP33YJL161W 543 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC28P40509 CKB2YOR039W 777 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC28P40509 CDC28YBR160W 897 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC28P40509 ZRC1YMR243C 1329 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC28P40509 HRK1YOR267C 2280 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC28P40509 MMT2YPL224C 1455 nt4.88□□□□□ -1.63
SEC28P40509 YEL067CYEL067C 588 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC28P40509 FAU1YER183C 636 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC28P40509 PRM10YJL108C 1152 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC28P40509 ISY1YJR050W 708 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC28P40509 YLR283WYLR283W 945 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC28P40509 PDX3YBR035C 687 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC28P40509 PCL10YGL134W 1302 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC28P40509 YGR125WYGR125W 3111 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC28P40509 IMD3YLR432W 1572 nt4.87□□□□□ -1.63
SEC28P40509 SAC1YKL212W 1872 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC28P40509 CUE5YOR042W 1236 nt4.86□□□□□ -1.63
SEC28P40509 RRP1YDR087C 837 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC28P40509 TPO2YGR138C 1845 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC28P40509 OCT1YKL134C 2319 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC28P40509 NNK1YKL171W 2787 nt4.85□□□□□ -1.63
SEC28P40509 TGL4YKR089C 2733 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC28P40509 YMR102CYMR102C 2505 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC28P40509 YDR444WYDR444W 2064 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC28P40509 LHP1YDL051W 828 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC28P40509 DAM1YGR113W 1032 nt4.84□□□□□ -1.63
SEC28P40509 PCT1YGR202C 1275 nt4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.5 ms