Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH5P33151 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH5P33151 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH5P33151 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH5P33151 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH5P33151 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH5P33151 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH5P33151 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH5P33151 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH5P33151 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH5P33151 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH5P33151 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH5P33151 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH5P33151 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH5P33151 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH5P33151 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH5P33151 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH5P33151 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH5P33151 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH5P33151 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH5P33151 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH5P33151 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH5P33151 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH5P33151 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH5P33151 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH5P33151 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH5P33151 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH5P33151 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH5P33151 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH5P33151 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH5P33151 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH5P33151 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH5P33151 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH5P33151 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms