Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RXRAP19793 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RXRAP19793 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RXRAP19793 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RXRAP19793 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RXRAP19793 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RXRAP19793 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RXRAP19793 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RXRAP19793 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RXRAP19793 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRAP19793 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRAP19793 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRAP19793 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRAP19793 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRAP19793 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRAP19793 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRAP19793 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRAP19793 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRAP19793 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRAP19793 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRAP19793 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RXRAP19793 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RXRAP19793 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RXRAP19793 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RXRAP19793 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RXRAP19793 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RXRAP19793 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RXRAP19793 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RXRAP19793 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RXRAP19793 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RXRAP19793 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RXRAP19793 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RXRAP19793 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RXRAP19793 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RXRAP19793 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RXRAP19793 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RXRAP19793 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RXRAP19793 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RXRAP19793 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RXRAP19793 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RXRAP19793 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RXRAP19793 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RXRAP19793 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RXRAP19793 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RXRAP19793 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRAP19793 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RXRAP19793 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RXRAP19793 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RXRAP19793 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RXRAP19793 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRAP19793 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRAP19793 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRAP19793 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRAP19793 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRAP19793 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRAP19793 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRAP19793 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRAP19793 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRAP19793 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRAP19793 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RXRAP19793 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RXRAP19793 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RXRAP19793 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RXRAP19793 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RXRAP19793 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RXRAP19793 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RXRAP19793 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RXRAP19793 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms