Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PABPC1P11940 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC1P11940 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms