Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM49CP0CI26 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49CP0CI26 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49CP0CI26 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms