Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DOAP06340 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DOAP06340 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DOAP06340 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms