Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MT-CO1P00395 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MT-CO1P00395 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-CO1P00395 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms