Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX3O60493 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX3O60493 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX3O60493 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX3O60493 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX3O60493 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX3O60493 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX3O60493 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX3O60493 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX3O60493 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX3O60493 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX3O60493 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX3O60493 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX3O60493 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX3O60493 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX3O60493 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX3O60493 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX3O60493 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX3O60493 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX3O60493 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX3O60493 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX3O60493 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX3O60493 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX3O60493 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX3O60493 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX3O60493 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX3O60493 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX3O60493 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX3O60493 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX3O60493 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX3O60493 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX3O60493 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX3O60493 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX3O60493 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX3O60493 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX3O60493 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX3O60493 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX3O60493 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX3O60493 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX3O60493 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX3O60493 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX3O60493 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX3O60493 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX3O60493 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX3O60493 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX3O60493 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX3O60493 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX3O60493 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX3O60493 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX3O60493 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX3O60493 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX3O60493 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX3O60493 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX3O60493 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX3O60493 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX3O60493 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX3O60493 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX3O60493 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX3O60493 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX3O60493 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX3O60493 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX3O60493 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX3O60493 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms