Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCP110O43303 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCP110O43303 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCP110O43303 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCP110O43303 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCP110O43303 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCP110O43303 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCP110O43303 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCP110O43303 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCP110O43303 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCP110O43303 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCP110O43303 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCP110O43303 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCP110O43303 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCP110O43303 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCP110O43303 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCP110O43303 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCP110O43303 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCP110O43303 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCP110O43303 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCP110O43303 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCP110O43303 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCP110O43303 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCP110O43303 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCP110O43303 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCP110O43303 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCP110O43303 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCP110O43303 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCP110O43303 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCP110O43303 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCP110O43303 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCP110O43303 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCP110O43303 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCP110O43303 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCP110O43303 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCP110O43303 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCP110O43303 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCP110O43303 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCP110O43303 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCP110O43303 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCP110O43303 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCP110O43303 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCP110O43303 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCP110O43303 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCP110O43303 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCP110O43303 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCP110O43303 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCP110O43303 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCP110O43303 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCP110O43303 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCP110O43303 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCP110O43303 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCP110O43303 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCP110O43303 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCP110O43303 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCP110O43303 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCP110O43303 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCP110O43303 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCP110O43303 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCP110O43303 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCP110O43303 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCP110O43303 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCP110O43303 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCP110O43303 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCP110O43303 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCP110O43303 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCP110O43303 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCP110O43303 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms