Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRTM2O43300 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRTM2O43300 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LRRTM2O43300 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21■□□□□ 0.95
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