Protein–RNA interactions for Protein: O14561

NDUFAB1, Acyl carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAB1O14561 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAB1O14561 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAB1O14561 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAB1O14561 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAB1O14561 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAB1O14561 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAB1O14561 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAB1O14561 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms