Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC1A8K0Z3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms