Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC182A6NF36 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC182A6NF36 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms