Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
A3GALT2U3KPV4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A3GALT2U3KPV4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms