Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN16Q9Y5I7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms