Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB6Q9Y5E3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms