Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LEMD3Q9Y2U8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LEMD3Q9Y2U8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.7 ms