Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC53.72■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC53.72■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC53.72■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC53.72■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC53.72■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC53.7■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC53.69■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC53.69■■■■■ 6.19
NISCHQ9Y2I1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC53.69■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.68■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC53.68■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.68■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC53.68■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC53.68■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC53.68■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC53.67■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC53.66■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC53.66■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC53.66■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC53.65■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC53.65■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.65■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.64■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC53.64■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.64■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC53.64■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.64■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC53.64■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.64■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC53.64■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC53.63■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC53.63■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC53.63■■■■■ 6.18
NISCHQ9Y2I1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC53.62■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC53.62■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.62■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC53.62■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC53.61■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.6■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC53.6■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC53.6■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC53.59■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.59■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC53.59■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.58■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC53.58■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC53.57■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC53.57■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.57■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC53.57■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.56■■■■■ 6.17
NISCHQ9Y2I1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.56■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.56■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC53.56■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.56■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC53.56■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.55■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.55■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.55■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC53.55■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC53.55■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC53.54■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC53.54■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.54■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC53.54■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.54■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.53■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.53■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC53.52■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.52■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC53.52■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC53.52■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.52■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.52■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC53.52■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC53.52■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC53.51■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.51■■■■■ 6.16
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