Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM161AQ9NX61 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM161AQ9NX61 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM161AQ9NX61 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM161AQ9NX61 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM161AQ9NX61 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM161AQ9NX61 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM161AQ9NX61 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms