Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAPOLBQ9NRJ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPOLBQ9NRJ5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPOLBQ9NRJ5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms