Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPRD1BQ9NQG5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRD1BQ9NQG5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.7 ms