Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBEC3GQ9HC16 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC3GQ9HC16 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms