Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRG3Q99928 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRG3Q99928 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms