Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMD3Q96D46 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMD3Q96D46 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMD3Q96D46 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMD3Q96D46 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NMD3Q96D46 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMD3Q96D46 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMD3Q96D46 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMD3Q96D46 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMD3Q96D46 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMD3Q96D46 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NMD3Q96D46 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMD3Q96D46 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NMD3Q96D46 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NMD3Q96D46 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NMD3Q96D46 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMD3Q96D46 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms