Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF428Q96B54 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF428Q96B54 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF428Q96B54 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF428Q96B54 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF428Q96B54 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF428Q96B54 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms