Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CSRNP3Q8WYN3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CSRNP3Q8WYN3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CSRNP3Q8WYN3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CSRNP3Q8WYN3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CSRNP3Q8WYN3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CSRNP3Q8WYN3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CSRNP3Q8WYN3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CSRNP3Q8WYN3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CSRNP3Q8WYN3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms