Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3Q8WWT9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3Q8WWT9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.2 ms