Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP33Q8TEY7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP33Q8TEY7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP33Q8TEY7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP33Q8TEY7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP33Q8TEY7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP33Q8TEY7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP33Q8TEY7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms