Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
C2CD4AQ8NCU7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms