Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM1BQ8NB78 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM1BQ8NB78 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms