Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RIOX2Q8IUF8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOX2Q8IUF8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOX2Q8IUF8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.4 ms