Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPARGC1BQ86YN6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PPARGC1BQ86YN6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms