Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR53Q7Z5U6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR53Q7Z5U6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms