Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMS2Q7Z4I7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LIMS2Q7Z4I7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMS2Q7Z4I7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms