Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIAT1Q6ZQX7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LIAT1Q6ZQX7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms