Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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LCN8Q6JVE9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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LCN8Q6JVE9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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LCN8Q6JVE9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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LCN8Q6JVE9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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LCN8Q6JVE9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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LCN8Q6JVE9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN8Q6JVE9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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