Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX3

TCEAL6, Transcription elongation factor A protein-like 6, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL6Q6IPX3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL6Q6IPX3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL6Q6IPX3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.6 ms