Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms