Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMTC4Q5T4D3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMTC4Q5T4D3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMTC4Q5T4D3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms