Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WASHC2DQ5SRD0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WASHC2DQ5SRD0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms