Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOHLH1Q5JUK2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOHLH1Q5JUK2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms